El centro organiza el servicio de transporte escolar en el marco del convenio con el Ayuntamiento de Benasque, de forma que se subvenciona el coste total, siendo así gratuito para los usuarios. El servicio se ofrece por la mañana, mediodía y tarde, lo que permite al alumnado aprovechar mejor los recursos del centro y fomentar la relación de personas que proceden de núcleos de población menores con escasas posibilidades de convivencia con otros jóvenes de su edad.

Durante el curso 2024-2025 se realizarán tres servicios de transporte cada día: uno de llegada al centro y dos de regreso a casa, organizados en una única ruta. La única excepción se producirá del 9 al 12 de septiembre de 2024 y del 16 al 20 de junio de 2025, que solo habrá dos servicios al no haber actividades por las tardes. El alumnado opta por uno solo de los servicios de regreso (mediodía o tarde) en función de sus necesidades y también de las circunstancias especificadas. En los servicios de mediodía y tarde, podrían producirse pequeñas modificaciones en el horario en función de los usuarios.
El alumnado deberá estar en la parada 5 minutos antes del horario señalado para evitar la acumulación de retrasos.